Cilj sistema za kvalitetu je izgradnja  institucijskih mehanizama za sistematsko vrednovanje i koordiniranje inicijativa i razvojnih programa s trajnom svrhom osiguranja i unapređenja kvaliteta te promovisanje visokih standarda profesionalnog i stručnog razvoja učesnika u svim područjima djelovanja Univerziteta sa Evropskim prostorom visokog obrazovanja.

Organizacija i standardi djelovanja sistema za osiguranje kvalitete podliježu načelima, kriterijima i mjerilima vrednovanja efikasnosti rada svaih organizacionih jedinica u sastavu Univerziteta, Univerzitetske biblioteke u Travniku, programa rada i studijskih programa.

U sistemu vrednovanja uvažavaju se posebnosti djelokruga rada svake pojedine organizacione jedinice Univerziteta.

Kultura kvalitete gradi se u svim aspektima djelovanja i kroz sve normativne akte i zasnovana je na principima koji kao cilj imaju izgradnju i očuvanje povjerenja svih aktera i podržavanje njihovog učešća u nastojanjima Univerziteta da primjenjuje kvalitet.

Principi kulture kvaliteta su:

• Osnaživanje internih kapaciteta u svrhu razvijanja ciljeva, inicijativa i mjera vezanih za kvalitet;
• Podsticanje svijesti o kvalitetu tako što se sistem za osiguranje kvaliteta predstavlja kao prilika, a ne prijetnja i što se podržavaju diskusije i razgovori o kvaliteti među interesnim grupama;
• Naglasak na povratnim informacijama i orijentacijskim funkcijama evaluacija;
• Naglasak na daljim aktivnostima u sistemu osiguranja kvalitete;
• Pravilan bilans kod donošenja odluka vezanih za kvalitet.

Sve interesne grupe Univerziteta (studenti, nastavnici, univerzitetska administracija i tehnička podrška i uprava Univerziteta) smatraju se unutrašnjim/internim korisnicima sistema za osiguranje kvalitete i promotorima osiguranja i unapređenja kvalitete Univerziteta.

Vanjski/eksterni korisnici (drugi nivoi sistema obrazovanja, privredni i društveni subjekti, lokalna i kantonalna uprava, zdravstvene ustanove itd.) uključeni su u provjeru valjanosti, svrsishodnosti i kvalitete rada Univerziteta kao izvor podataka za vrednovanje i kao sastavni dio organizacione jedinice sistema za kvalitetu Univerziteta.

Područja vrednovanja sistema za kvalitetu:

• Pravila i postupci u trajnom osiguranju i unapređenju kvalitete Univerziteta,
• Promjena sistema na svim nivoima vanjske i unutrašnje provjere (samoprovjere),
• Status studijskih programa,
• Upis studenata u studijske propgrame,
• Tehnički normativi,
• Ljudski resursi,
• Proces učenja i rad nastavnog osoblja,
• Proces vježbi i rad asistenata,
• Proces vrednovanja studentskog rada,
• Informisanost
• Opremljenost za obrazovanje i naučno – istraživačku djelatnost,
• Institut,
• Biblioteka,
• Informatička opremljenost i aktuelnost informacijskog sistema,
• Administrativno – tehnički resursi,
• Nadogradnja u primjeni akademskog standarda,
• Nadogradnja u primjeni studentskog standarda i
• Javnost djelovanja.

Tijela sistema za kvalitetu Univerziteta su:

1. Odbor za kvalitetu Univerziteta u Travniku
2. Odjel za unapređenje kvaliteta Univerziteta u Travniku
3. Odbori za upravljanje i unapređenje kvaliteta na organizacionim jedinicama (fakultetima) Univerziteta.

Tijela sistema za kvalitetu djeluju integrirano i dijele odgovornost za osiguranje i unapređenje kvaliteta u svim područjima djelovanja Univerziteta uz punu saradnju sa Rektorom Univerziteta i dekanima Fakulteta.