Odgovornost za akademska pitanja na UNT-u ima Senat kao najviše akademsko tijelo koje čine predstavnici akademskog osoblja i studenata. Senat čine rektor, prorektori, dekani i prodekani organizacionih jedinica, a po potrebi i predstavnici ostalog akademskog osoblja.
Najmanje 15% članova Senata su studenti, predstavnici studenata iz svakog ciklusa studija, sa svih organizacionih jedinica UNT-a. Od člana 55. Statuta Univerziteta u Travniku navodi se način rada Senata.
